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陳超

研究員

PI介紹

深圳市轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究院(深圳市第二人民醫(yī)院),研究員,生物化學與分子生物學博士。入選2018年全國博士后創(chuàng)新人才支持計劃。主持國際(地區(qū))合作與交流項目(中-俄)、國家重點研發(fā)計劃項目-子課題、國家青年基金、博士后面上項目。以第一作者、共同第一作者、共通訊作者在 Nature Microbiology、PNAS、Nature Communications、mBio等期刊發(fā)表SCI論文。

教育背景

2012年09月-2017年12月 武漢大學 藥學院 博士

2008年09月-2012年06月 武漢大學 藥學院 學士

工作經(jīng)歷

2021年7月至今,深圳市第二人民醫(yī)院轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究院,研究員 

2018年04月至2021年05月,武漢大學 中南醫(yī)院,博士后

研究方向和興趣

(1)微生物表觀遺傳修飾

表觀遺傳以不改變基因的方式,精準調(diào)控基因表達,豐富了生物遺傳多樣性,具有不容忽視的重要生物醫(yī)學意義。其中,發(fā)掘新型表觀遺傳修飾的特征及其應(yīng)用價值也是極其關(guān)鍵的環(huán)節(jié)。本人致力于運用SMRT和Nanopore等新型測序技術(shù),繪制DNA磷硫?;揎椡暾麍D譜,鑒定新型修飾特征,建立起完善的磷硫酰化修飾表征方案?;谖⑸锉碛^修飾特征,研究DNA磷硫?;图谆g的相互作用及其共進化特征,探究DNA磷硫?;到y(tǒng)和CRISPR系統(tǒng)互作網(wǎng)絡(luò)及其應(yīng)用。由于表觀遺傳在調(diào)控基因表達和生理代謝中展現(xiàn)出重大作用,決定了其參與到胞內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)平衡、微生物致病性、防御系統(tǒng)建立等重要生命活動中,在微生物進化、疾病防治、噬菌體療法等領(lǐng)域的奠定理論根基,展現(xiàn)實踐潛力。

(2)工程化噬菌體的生物醫(yī)學應(yīng)用

自然界中無處不在的噬菌體,憑借其數(shù)量龐大、種類繁多,構(gòu)筑成蘊含著豐富生物遺傳密碼的天然寶庫。眾所周知,T4 DNA連接酶和T7 RNA聚合酶等經(jīng)典噬菌體元件得以開發(fā)應(yīng)用,推動了實驗技術(shù)的革命,成為科研探索中必要的遺傳操作技術(shù)。由于臨床中抗生素濫用,超級細菌肆虐全球,亟待有效的抑菌殺菌新技術(shù)開發(fā),而噬菌體基因組上蘊含著高效的裂解酶、抗菌肽等元件,具有極其重要的挖掘潛力。深入開展對自然界中噬菌體的分離鑒定工作,解析噬菌體與宿主間的復(fù)雜互作網(wǎng)絡(luò),發(fā)掘噬菌體基因組上潛在的轉(zhuǎn)座元件、調(diào)控元件和抗菌元件等,展現(xiàn)出在臨床病原菌靈敏檢測和耐藥菌高效防治領(lǐng)域的生物醫(yī)學應(yīng)用價值。此外,開發(fā)有效的噬菌體遺傳操作策略,構(gòu)筑完善的噬菌體工程化體系,建立起豐富的工程化噬菌體文庫,將助力于推動噬菌體在臨床診療方面的理論研究和應(yīng)用開發(fā)。

科研項目


1.國家自然科學基金委,國際(地區(qū))合作與交流項目(中-俄),32361133560,細菌中DNA磷硫?;拗?修飾系統(tǒng)與Argonaute系統(tǒng)的相互作用研究,2024-01至2026-12,150萬元,在研,主持;

2.科技部,國家重點研發(fā)計劃項目-子課題,2022YFA0912503-03,高效污染物代謝元件構(gòu)建及基因組編輯系統(tǒng)優(yōu)化,2022-11 至 2027-10,35萬元,在研, 主持;

3.青年科學基金,31800044,利用Nanopore測序技術(shù)繪制細菌磷硫?;揎椀幕蚪M圖譜,2019/01-2021/12, 25萬元,在研,主持;

4.博士后創(chuàng)新人才支持計劃,2018年,生物學;

5.博士后科學基金面上資助(一等),2018M640727,基于納米孔測序技術(shù)的細菌基因組磷硫?;揎椌毝ㄎ?,2018/09-2020/03, 8萬元,結(jié)題,主持。

代表性成果

1. Jiang S#, Chen C#, Huang W, He Y, Du X, Wang Y, Ou H, Deng Z, Xu C, Jiang L, Wang L, Chen S*. A widespread phage-encoded kinase enables evasion of multiple host antiphage defence systems. Nat Microbiol. 2024 Dec;9(12):3226-3239.

2. Chen C#, Wang L#, Chen S, Wu X, Gu M, Chen X, Jiang S, Wang Y, Deng Z, Dedon PC, Chen S*. 2017. Convergence of DNA methylation and phosphorothioation epigenetics in bacterial genomes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 114:4501-4506.

3. Cao B#, Chen C#, DeMott MS#, Cheng Q, Clark TA, Xiong X, Zheng X, Butty V, Levine SS, Yuan G, Boitano M, Luong K, Song Y, Zhou X, Deng Z, Turner SW, Korlach J, You D*, Wang L*, Chen S*, Dedon PC. 2014. Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences. Nature communications 5:3951.

4. Jiang S, Chen K, Wang Y, Zhang Y, Tang Y, Huang W, Xiong X, Chen S, Chen C*, Wang L*. A DNA phosphorothioation-based Dnd defense system provides resistance against various phages and is compatible with the Ssp defense system. mBio. 2023 Jun 1:e0093323.

5. Xu C, Rao J, Xie Y, Lu J, Li Z, Dong C, Wang L, Jiang J*, Chen C*, Chen S*. The DNA Phosphorothioation Restriction-Modification System Influences the Antimicrobial Resistance of Pathogenic Bacteria. Microbiology Spectrum. 2023 Feb 14;11(1):e0350922.