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王芳

陳實(shí)研究團(tuán)隊(duì)co-PI

PI介紹

深圳市轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院(深圳市第二人民醫(yī)院)陳實(shí)研究團(tuán)隊(duì)PI。2021年博士畢業(yè)于澳門大學(xué),生物醫(yī)藥專業(yè)。主要從事病原微生物的相關(guān)研究,研究方向?yàn)橹虏∥⑸铮?xì)菌、真菌)在感染和致病過(guò)程中的致病機(jī)制和微生物生理性能探究。主要研究成果以第一或共同通訊作者發(fā)表于Nature microbiology(封面),Clinical Microbiology Reviews(封面), PLOS Genetics和Virulence等期刊。主持1項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目,科技部重點(diǎn)專項(xiàng)子課題項(xiàng)目1項(xiàng)、深圳市人才項(xiàng)目1項(xiàng)。

教育背景

2008年09月-2012年07月內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院制藥工程本科;

2012年09月-2015年06月南開大學(xué)泰達(dá)生物技術(shù)研究院微生物學(xué)碩士;

2016年01月-2021年03月澳門大學(xué)健康科學(xué)學(xué)院生物醫(yī)藥博士。

工作經(jīng)歷

2021年09月至今,深圳市第二人民醫(yī)院轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院,陳實(shí)研究團(tuán)隊(duì)PI

研究方向和興趣

1.      應(yīng)用多組學(xué)方法探究病原真菌與細(xì)菌的致病機(jī)制

  應(yīng)用基因組學(xué)、比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué),結(jié)合生物信息學(xué)分析和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手段,開展關(guān)于煙曲霉(Aspergillus)、白色念珠菌(Candida)、馬爾尼菲青霉菌(Talaromyces)等常見臨床致病真菌的致病機(jī)制和調(diào)控機(jī)理研究。同時(shí),致病細(xì)菌和真菌的共感染事件在臨床病人中層出不窮,應(yīng)用多組學(xué)方法,體內(nèi)、體外了解致病細(xì)菌和真菌間的相互影響、以及兩類病原微生物與所侵染宿主的相互作用,可以為臨床診斷和治療提供理論基礎(chǔ)和潛在給藥靶點(diǎn)。

2.      微生物體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究

  轉(zhuǎn)錄,作為遺傳中心法則的重要一步,是將體內(nèi)遺傳信息展現(xiàn)為各種生物學(xué)特征的第一步。無(wú)論是原核還是真核生物,細(xì)胞內(nèi)的基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程都受著精細(xì)調(diào)控,以確保生物體精準(zhǔn)地應(yīng)對(duì)各種生存環(huán)境。轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子作為可識(shí)別結(jié)合特定靶標(biāo)DNA序列的蛋白,在轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用中尤為重要。利用現(xiàn)有的研究手段,包括ChIP-Seq, RNA-seq以及DNA-pull down等,結(jié)合多種突變庫(kù)應(yīng)對(duì)環(huán)境刺激的大規(guī)模篩選和轉(zhuǎn)錄應(yīng)答比較,對(duì)包括細(xì)菌和真菌在內(nèi)的各種微生物生理過(guò)程進(jìn)行研究。同時(shí),開展對(duì)新的環(huán)境、臨床分離菌株的組學(xué)比較,并探究其生理性能及動(dòng)態(tài)、實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)病原菌侵染過(guò)程中的應(yīng)答反應(yīng),從而從基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)等多方面尋找臨床菌株在進(jìn)化過(guò)程的變化。

科研項(xiàng)目

[1]. 國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目“構(gòu)巢曲霉孢子打破休眠前后的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究”(項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào):32200024)30萬(wàn),主持,2023.01-2025.12)

[2]. 國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目“水環(huán)境污染修復(fù)的合成微生物體系設(shè)計(jì)與構(gòu)建”(項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào):2022YFA 0912500,總經(jīng)費(fèi)1973萬(wàn)),子課題負(fù)責(zé)人,34.1萬(wàn)(2022.11-2027.10)

[3].深圳市優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才(博士啟動(dòng)項(xiàng)目)“病原真菌煙曲霉染色體大片段丟失影響致病能力的分子機(jī)制研究”(項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào):RCBS20221008093108030), 30萬(wàn),主持,(2023.04-2025.04)


代表性成果

1.      Fang Wang, Pooja Sethiya, Xiaohui Hu, Shuhui Guo, Yingying Chen, Ang Li, Kaeling Tan, Koon Ho Wong*. Transcription in fungal conidia before dormancy produces phenotypically variable conidia that maximize survival in different environments. Nature Microbiology. 2021 Aug;6(8):1066-1081IF=28.3(獨(dú)立第一作者,封面文章,F1000推薦,Nature Microbiology雜志亮點(diǎn)評(píng)論)

2.      Fang Wang, Runhua Han, Shi Chen*. An Overlooked and Underrated Endemic Mycosis—Talaromycosis and the Pathogenic Fungus Talaromyces marneffei. Clinical Microbiology Reviews. 2023 Mar 23;36(1):e0005122.IF=36.8)(獨(dú)立第一作者,封面文章,2023年度高被引)

3.      Ana Cristina Colabardini#, Fang Wang#*, Zhengqiang Miao#, Lakhansing Pardeshi, Clara Valero, Patrícia Alves de Castro, Daniel Yuri Akiyama, Kaeling Tan, Luisa Czamanski Nora, Rafael Silva-Rocha, Marina Marcet-Houben, Toni Gabaldón, Taicia Fill, Koon Ho Wong*, and Gustavo H. Goldman*. Chromatin profiling reveals heterogeneity in clinical isolates of the human pathogen Aspergillus fumigatus. PLoS Genetics. 18(1):e1010001. 2022.IF=4.5(共同第一作者(第2),共同通訊作者

4.      Fang Wang#, Ting Yao#, Wen Yang#, Pan Wu, Yutao Liu, Bin Yang*. Protocol to detect nucleotide-protein interaction in vitro using a non-radioactive competitive electrophoretic mobility shift assay. STAR Protocols. 3(4):101730. 2022.(共同第一作者(第1))

5.      Fang Wang#, Hongmin Sun#, Chenbo Kang, Jun Yan, Jingnan Chen, Xuequan Feng*, and Bin Yang*. Genomic island-encoded regulatory proteins in enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7. Virulence. 2024 (Accepted).IF=5.2(共同第一作者(第1))

6.      Yuan Nong#, Fang Wang#*, Shi Chen*. Morphology, development, and pigment production of Talaromyces marneffei are diversely modulated under physiologically relevant growth conditions. Current Microbiology. 2024 (Accepted).IF=2.6)(共同第一作者(第2),共同通訊作者